Родился 11 октября 1970 года в городе Карталы Челябинской области.
В 1992 году закончил Ульяновский политехнический институт (ныне - университет), строительный факультет, специализация «инженер-строитель по специальности теплогазоснабжение и вентиляция». На военной кафедре института ему присвоено звание лейтенанта запаса.
С 1992 по 1993 год работал инженером-проектировщиком в институте «Гипроэнергоремонт», с 1993 по 1998 год — инженером производственно-технического отдела, начальником режимно-наладочной службы муниципального жилищно-ремонтного эксплуатационного предприятия города Ульяновска, с 1998 по 2002 год — начальником договорного отдела, начальником расчетно-кассового центра муниципального учреждения жилищно-коммунального хозяйства «Дирекция единого заказчика», с апреля по август 2002 года — заместителем главного инженера муниципального унитарного предприятия «Городская управляющая компания», с августа 2002 по май 2003 года — начальником отдела ведомственного жилого фонда Комитета жилищно-коммунального хозяйства и энергетики, с мая 2003 по март 2004 года — председателем Комитета жилищно-коммунального хозяйства и энергетики.
С 12 марта 2004 года Сергей Гигирев — заместитель мэра (главы) города Ульяновска, с 2005-го - директор департамента жилищно-коммунального комплекса администрации Ульяновской области, в феврале 2012 года возглавил ОГКУ «Фонд содействия реформированию ЖКК и энергоэффективности Ульяновской области».
В июне 2012 года назначен на должность министра энергетики и ЖКК Ульяновской области (в октябре того же года отправлен в отставку, однако практически сразу же губернатор Морозов передумал и вернул Гигирева на место). В марте 2013-го уже сам Гигирев объявил о том, что собирается подать в отставку, но вскоре меняет решение; но уже в июне того же года губернатор Сергей Морозов в очередной раз увольняет Гигирева с поста министра. Гигирев вновь возглавил Фонд содействия реформированию ЖКК, но 27 октября 2014 года Морозов освобождает Гигирева от этой должности.
В апреле 2015 года следственный комитет возбудил уголовное дело против экс-министра строительства и ЖКХ Сергея Гигирева, его обвинили в том, что в 2012-м он оставил без жилья 300 детей-сирот.
С марта 2017 года Сергей Гигирев - заместитель тогдашнего главы администрации города Ульяновска Алексея Гаева и начальник управления по строительству администрации города Ульяновска. 13 октября 2017 года депутаты Гордумы потребовали уволить Гигирева (причина: 142 дома в середине октября больше чем на сутки остались без горячей воды и отопления), но за Сергея Владимировича тут же вступились (в частности, директор филиала «Ульяновский» ПАО «Т Плюс» Валентин Трубчанин и депутат ЗСО председателя комитета по жилищной политике, ЖКХ и энергетике (на тот момент) Геннадий Антонцев).
Был заместителем главы города по развитию городской инфраструктуры (назначен на должность 19 октября 2018 года, уволился в мае 2019 года).
В декабре 2020 года был назначен генеральным директором ООО "РИЦ-Регион".
17 марта 2004 года награжден Почетной грамотой Госстроя России.
Сергей Гигирев женат, имеет сына.