В 2013 году был назначен на должность главы МУП «Горсвет». До этого 14 лет проработал в должности начальника производственной лаборатории МУП «УльГЭС».

В марте 2014 года был переведен в МУП «Ульяновскэлектротранс» на должность директора. Повысил себе запрплату, чем вызвал гнев экс-губернатора Сергея Морозова. Он поручил уволить Исаева и создать временную дирекцию по финансовому оздоровлению МУП «УЭТ». Долг предприятия на тот момент составил более 80,6 млн рублей, и энергосбытчики угрожали отключением питания тяговых подстанций, что привело бы к остановке электротранспорта в Засвияжье. Долг погасили деньгами, выделенными на ремонт трамвайных путей. Сергей Морозов тогда отметил, что глава убыточного предприятия получает зарплату в 116 тысяч рублей в месяц.

В 2014 году, после слияния “Горсвета” с “УльГЭСом”, Исаев занимал должность заместителя директора предприятия по городскому освещению.

Силовики вспомнили про Исаева в свете конфликтной ситуации, которая, впрочем, завершилась ничем. Смысл в том, что, по мнению компетентных лиц, сотрудники УльГЭС разработали специальную компьютерную программу для управления уличным освещением «Сети УО +», которую после адаптации в 2018 году Роман Исаев зарегистрировал в Роспатенте на себя. Проверка, проведенная в 2021 году, факта плагиата не нашла, равно как и попытки хищения денежных средств в крупном размере при сдаче программного обеспечения муниципальному предприятию в аренду. В итоге, в возбуждении уголовного дела было отказано – признаков состава преступления не нашлось.

В последние годы Роман Исаев трудился заместителем директора в Центре управления городом и курировал отдел IT-инфраструктуры.

9 февраля 2024 года был назначен директором МБУ «Горсвет».