Родилась 28 сентября 1956 года в селе Дрожжаное (Татарстан).

Образование: Самарская государственная экономическая академия по специальности «Бухгалтерский учет и аудит» (1995), Институт высшего управленческого персонала Ассоциации выпускников Академии народного хозяйства при правительстве РФ по программе «Основы местного самоуправления» (2005), Ульяновский государственный университет по специальности «Юриспруденция» (2005).

Трудовую деятельность начала в 1977 году в системе торговли Ульяновского Горкоопторга. До начала политической карьеры более 20 лет работала в ОАО «Темп» (10 лет в должности гендиректора). Была владелицей городской женской газеты «Аглая». Состояла в общественной комиссии по делам женщин и в комиссии по семье при правительстве РФ и при Академии предпринимательства и бизнеса Аркадия Вольского.

Являлась депутатом Ульяновской городской Думы первого созыва (1996-2000 гг.), депутатом Законодательного собрания Ульяновской области третьего созыва (членом фракции «Единая Россия»), председателем комитета по бюджетной политике, налогам и предпринимательству (в компетенцию комитета входили вопросы принятия бюджета Ульяновской области на очередной финансовый год, его исполнение, анализ финансирования областных целевых программ средствами областного бюджета, а также ведение вопросов, касающихся бюджетного устройства Ульяновской области и реформирования региональных финансов).

Была лауреатом областной премии «Женщина года», включена в энциклопедию «Современники России» (в 2009 году).

В мае 2016 года в отношении Алсу Балкишиевой СУ СК РФ по Ульяновской области возбудил уголовное дело по статье 290 УК РФ (Получение должностным лицом взятки, совершенное в особо крупном размере, с вымогательством взятки). В декабре 2016 года уголовное дело передано в Ленинский районный суд Ульяновска. 15 февраля 2017 года экс-депутат была признана виновной по вменяемой ей статье, однако в качестве наказания получила лишь штраф в 4,8 млн рублей. Прокуратура подала апелляцию. Областной суд встал на сторону обвинения и ужесточил наказание для Алсу Балкишиевой. Она приговорена к 5 годам лишения свободы условно и к штрафу, равному сумме взятки, помноженной на три – т.е. 13,8 млн рублей.

В апреле 2018 года Алсу Балакишиева переехала из Ульяновска в Ставропольский край.

В мае 2019 года суд удовлетворил исковое заявление о взыскании с Балакишиевой в доход РФ более 4,2 млн. рублей, которые она получила в качестве взяток. Она полностью погасила эту сумму.

Балакишиева - о женщинах во власти: «Наши женщины-депутаты - это трудоголики, «рабочие лошадки», они умело исполняют свои обязанности, они профессионалы, они принимают активное участие и в законотворчестве, и в общении с избирателями. И при этом они находят время для семьи, для домашнего хозяйства. Меня не так просто дискриминировать, как вы знаете... Если в парламенте не будут присутствовать женщины, то его надо переизбирать».